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谢鹭博士介绍(PI)

 

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谢鹭


博士,三级研究员,教授,博导


上海科学院直属上海生物信息技术研究中心副主任


上海市科苑路12782楼,邮编201203;电话:021-20283705


网页:http://www.scbit.org;


https://www.researchgate.net/profile/Lu_Xie4


 

教育训练:

 

1985.9-2000.7:中南大学湘雅医学院,六年制临床医学本科(1985-1991),肿瘤免疫学硕士(1991-1994),实习研究员(1994-1996),肿瘤病理生理学博士(1996-2000)。于2000年获中南大学医学博士学位。

 

2000.8-2005.7:美国范德堡大学(Vanderbilt University)医学院,博士后。

 

工作经历:

 

2005.8-目前(2020.8):上海生物信息技术研究中心。创建应用医学研究组(2005-)。副研究员(2005-2009),研究员(2010-),三级研究员(2019-)。任主任助理(2008-2011),党支部副书记(2012-),副主任(2013-)。兼任生物信息研发服务事业部主管(2014-)。

 

研究方向:蛋白质功能研究涉及定位、定量、翻译后修饰到相互作用,现集中于蛋白质功能网络的多组学水平数据注释及整合分析;转化医学研究主要从事各遗传信息水平分子标记物筛选、临床预后疗效等预测模型建立,现拓展到药物重定位以及网络药物研究。目前工作方向包括多组学数据分析及整合、肿瘤免疫治疗、临床建模及人工智能辅助决策系统研究。同时致力于精准医学生物信息平台研发、以及生物信息学人才培养。总的宗旨是利用生物信息学手段分析多组学数据以及临床数据,为临床应用转化提供理论基础和软件工具。

 

承担项目:

 

曾主持国家项目包括:863课题一项,重点研发计划子课题一项,973子课题一项,863子课题两项,科技重大专项子课题两项(十一五、十二五),国家自然科学基金三项,中国人类蛋白质国际合作项目子课题两项。曾主持地方项目包括:上海市浦江人才计划,上海市自然科学基金,上海市科技创新基金,上海市协同创新集群基金等。

 

科技奖励:

 

2019年入选上海领军人才。曾获上海市自然科学一等奖(2014:蛋白质功能特征的生物信息学系统研究),上海市五一巾帼创新奖(2010:个人),上海市浦江人才(2006),美国癌症协会(AACR)年会年轻学者奖(2004),湖南省科技进步二等奖(2001:鼻咽癌抗独特型抗体的制备及主动免疫研究),湖南省医药卫生科学技术进步一等奖(1996)。

 

荣誉称号:

 

2010-2014年度上海市先进工作者(劳模);2011-2012年度上海市三八红旗手标兵提名奖。

 

学术任职:

 

中国医药生物技术协会基因检测分会委员会委员,上海市生物信息学会理事,中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会委员,中国医药生物技术协会生物信息技术分会委员会委员。上海海洋大学教授、博导,南京医科大学科学型博导,复旦大学、上海理工大学硕导。

 

发表论文:

 

截至20208月国内外已发表学术论文超过140篇,其中国际杂志SCI论文的总影响因子约500分,引用次数超过4200次。文章全文链接: https://www.researchgate.net/profile/Lu_Xie4/research

 

代表性软件工具:

 

dbPepNeo: 肿瘤新抗原肽数据库

 

Ineo-Epp:肿瘤新抗原免疫原性预测

 

ProGeo-Neo:蛋白质基因组学流程预测肿瘤新抗原

 

OmicsBean-Cancer:肿瘤多组学数据分析及制图

 

dbPHCC:肝癌预后分子及预后建模

 

ShanghaiScore:多中心肝癌术后病人预测及辅助治疗建议

 

dbDEPC3.0:肿瘤差异表达蛋白质分子标记物

 

SysPTM2.0:全翻译后修饰数据库

 

SyStemCell:干细胞分子标记物数据库

 

 

 

团队照片: 

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